Primer genoma de referencia del venado de campo (Ozotoceros bezoarticus)

El venado de campo (Ozotoceros bezoarticus) fue históricamente el ungulado más abundante de la región neotropical. Sin embargo, el avance de las actividades agropecuarias, la caza y la pérdida de hábitats naturales provocaron una fuerte fragmentación y aislamiento de sus poblaciones. En Uruguay existen dos poblaciones silvestres en Rocha y Salto, que suman aproximadamente 2500 individuos, y una en cautiverio en la Estación de Cría de Fauna Autóctona (ECFA) en Maldonado (N=180). Con el objetivo de generar recursos genómicos que complementen estrategias de conservación, desarrollamos el primer genoma de referencia para la especie. Para ello, se capturaron dos ejemplares machos adultos de la población de Salto, bajo protocolo aprobado por Comisión de Ética en el Uso de Animales (CEUA), lo que permitió obtener muestras frescas y extraer ADN de alto peso molecular, esencial para tecnologías de lectura larga. Tras la contención química con equipos Daninject, se tomaron datos biométricos y se obtuvo una biopsia de piel de cada ejemplar, que fue preservada en criotubos con medio DMEM + DMSO mediante congelación lenta en nitrógeno líquido para asegurar la integridad del ADN hasta su utilización. Una de las muestras fue secuenciada en una celda Revio SMRT (PacBio Revio) y la otra con tecnología Hi-C en Illumina NovaSeqX. Se obtuvieron más de 5 millones de lecturas, con longitud promedio de 19,1 kb y N50 de 19,4 kb. Estos datos de alta cobertura y continuidad permitieron el ensamblaje de novo de un genoma de aproximadamente 2,6 Gb, con un valor scaffold N50 de 5 Mb, indicando alta calidad. La obtención del primer genoma de referencia de un cérvido endémico del Neotrópico representa un insumo clave para el diseño de estrategias de conservación que aseguren la viabilidad genética a largo plazo del venado de campo en la región.